copykat包CNV预测
CNV工具
说明文档
提取部分细胞
CNV预测
CNV结果的可视化
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1、提取部分细胞
导入数据
细胞类型
seurat_clusters
cell_type
特定细胞(多个细胞用 , 隔开)
提交
提取部分细胞进行CNV预测
2、CNV预测
导入数据
提交
tsne.cnv.jpg
umap.cnv.jpg
使用copykat包对单细胞数据进行cnv的预测，这里设置每一个染色体中至少有 5 个基因来计算 DNA 拷贝数，每个片段至少取 25 个基因， KS.cut为0.15，euclidean的方法计算距离
3、CNV结果的可视化
导入数据
颜色
+
-
选择分列的名称
提交
tsne.cnv.jpg
umap.cnv.jpg
CNV结果的可视化
