单细胞WGCNA分析
单细胞WGCNA分析
说明文档
WGCNA分析(一)
WGCNA分析(二)
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1、WGCNA分析(一)
导入数据
细胞类型
seurat_clusters
cell_type
样本名称
提交
这里使用hdWGCNA包对单细胞数据进行WGCNA分析，对cell_type /seurat_clusters细胞类型和不同样本分组进行分析，构建共表达网络，划分基因module，并输出module中top200个基因，此为第一步的内容，而第二步中，我们选择top基因数量使用Ucell的算法计算每一个module的评分
2、WGCNA分析(二)
导入数据
top基因数计算score
细胞类型
seurat_clusters
cell_type
提交
这里使用hdWGCNA包对单细胞数据进行WGCNA分析，对cell_type /seurat_clusters细胞类型和不同样本分组进行分析，构建共表达网络，划分基因module，并输出module中top200个基因，此为第一步的内容，而第二步中，我们选择top基因数量使用Ucell的算法计算每一个module的评分